本書據宋代傳位懸案「燭影斧聲」為藍本，加上宋初隱士陳搏（有名為陳摶）構思而成。書名《封神劫》，是指宋代陳搏被宋太宗趙光義封為神仙，因皇家奪位所釀成的浩劫。

晉王爺趙光義迫死違命侯李煜，追隨李煜的南唐將軍李浪決意為主子報仇，準備行刺趙光義。

宋太祖趙匡胤年事已高，當年禮聘陳搏下山治病，陳搏不負所託，獲賜真人府，地位日高，更是德昭太子的劍術導師。

晉王爺趙光義為人喪心病狂，當年太后因有「金匱之盟」，故趙光義實為儲君。陳搏恐趙光義繼位，天下必永無寧日，大宋江山危矣，故遣門下弟子不斷蒐集趙光義的惡行證據，希望太祖趙匡胤能夠回心轉意，改立德昭為儲君。

李浪行刺趙光義失敗，被陳搏徒兒香菱所救，帶往拜見陳搏。李浪與陳搏的目的既同，自然一拍即合。李浪邀請落草為寇的南唐遺民花虎，加強實力對抗趙光義。李浪等人行刺再度失敗，雙方爭鬥開始白熱化。

趙光義為控制繼位的主動權，又不忿侄兒德昭與己爭位，乃派手下天絕、地滅暗算太子，用碧靈毒針刺札其腦門，太子中毒遂變得痴獃。

形勢危急，李浪、香菱等人護送太子回真人府請陳搏救治。所謂「藥醫不死病」，陳搏回天乏術，無計可施，為保國師與華山派領導武林之位，只有靦顏改投晉王府，及後乃有趙光義「燭影斧聲」的弒君殺兄之事。

陳搏為撇脫此事，不惜屠殺花虎滿門。陳搏門下弟子不齒此事，紛紛離開真人府。

陳搏雖得敕封神仙，但落得眾叛親離的結局。李浪及香菱在他「封神」後，登門決一死戰……