世界雖然毀滅了，光明卻因此到來，末日帶來的災禍，將是搶救人類的轉機……

一七二二年。第二次黑暗時代降臨了。

星星墜落地球，西歐諸國毀於傾刻之間，全是陰謀滅絕人類的可怕生物所為。俄皇彼得大帝趁勢發動攻擊，軍隊勢如破竹地橫掃歐陸。

另一方面，半個地球之外，柯騰．馬瑟與海盜黑鬍子加上殖民地的高官顯貴組成遠征隊，遠渡大西洋想知道舊世界的下場。同行者有一名巧克陶族良族人「紅鞋」，他與無形世界緊密相連，也因此預知了人類必須面對逼近的慘烈時刻。

但是，祕密即將由躲在古都布拉格的兩人解開——聰明絕頂幾近於瘋狂的艾薩克．牛頓，以及他的學徒班傑明．富蘭克林，但在彼得大帝的圍城攻擊，還有神祕天使的阻隢之間，他們也將自身難保……